2017年3月7日，財政部、科技部、教育部、發展改革委聯合印發《關于進一步做好中央財政科研項目資金管理等政策貫徹落實工作的通知》（以下簡稱《通知》），對相關部門和單位在中央財政科研項目資金管理方面的責任和作用提出明確要求，并進一步細化了科研項目資金管理改革舉措的具體內容。其中，就中央財政科研項目資金管理中引入會計師事務所開展財務審計作出明確規范。
《通知》強調，項目主管部門要加強對承接科研項目財務審計委托任務的會計師事務所的指導和培訓，提高其政策理解和把握能力，促進提升財務審計工作質量；規范對承接科研項目財務審計委托任務的會計師事務所選聘程序，完善信用管理體系，會同財政部門對嚴重違規會計師事務所的嚴重不良信用記錄記入“黑名單”。《通知》要求，中國注冊會計師協會要制定科研項目財務審計操作指引，明確會計師事務所從事科研項目財務審計工作要求和技術規范，將科研項目財務審計納入執業質量檢查范圍。會計師事務所要建立健全相關質量控制機制，切實提升服務能力和審計質量。